Сергей Иванович Труфанов родился 01 февраля 1969 года в с. Новотроицкое Бейского района Хакасии.
В 1993 году окончил инженерный факультет Красноярского государственного аграрного университета по специальности «Механизация сельского хозяйства». Также проходил обучение в ХГУ им. Н.Ф. Катанова по специальности «Государственное и муниципальное управление».
Работал главным механиком ООО ТПК «Валек». С 1997 года трудился главным инженером-энергетиком Министерства сельского хозяйства и продовольствия Хакасии.
С 1999 года трудовая деятельность связана с Государственной инспекцией по надзору за техническим состоянием самоходных машин и других видов техники РХ, где начинал с должности инспектора, а с 2009 года возглавлял Гостехнадзор Хакасии.